Se recomienda visitar los museos que se hallan en esta ciudad. Junto al importante palacio Arzobispal, en donde se reunieron por primera vez Isabel la Católica y Cristóbal Colón, se encuentra el convento de San Bernardo, instituido en 1618 por Bernardo de Sandoval, quien era en ese año Arzobispo de Toledo. El interior de la misma se destaca por su planta elíptica, la cual está recubierta por una cúpula con forma de óvalo. A su alrededor se pueden visitar seis capillas que muestran obras de Angelo Nardi, quien pintó la cámara de Felipe III.

El museo arqueológico está situado frente al torreón Tenorio. En las inmediaciones se encuentra al Casa de la Entrevista, la cual está habilitada para exposiciones que ocupa el lugar en el que estaba el convento de San Juan de la Penitencia.

También recomendamos visitar el oratorio de San Felipe Neri y el Hospital de Antezana, la intitición sanitaria más antigua de España. Su construcción finalizó en el año 1483 y su fin era para atender a los enfermos que no poseían los suficientes medios económicos para atender su salud. Como cirujano trabajó en este lugar Rodrigo Cervantes, y en sus años de estudiante en Alcalá San Ignacio de Loyola cocinó para los internados.